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PyToxo
- Los estudios de asociación del genoma completo analizan marcadores genéticos con el fin de poder asociar una determinada variación genética a una enfermedad. Los estudios de asociación contemporáneos se centran en interacciones epistáticas, el fenómeno por el que la expresión de un determinado gen se ve afectada por la de otros genes independientes. La forma más común de representar interacciones epistáticas es a través de tablas de penetrancia.
Aunque la mayoría de simuladores que permiten crear conjuntos de datos de casos-controles para estudios de asociación admiten el uso de estas tablas, en general no pueden crearlas o tienen bastantes limitaciones a la hora de hacerlo. PyToxo es una herramienta software desarrollada en Python para calcular tablas de penetrancia de modelos de epistasia de alto orden. PyToxo es una reimplementación de Toxo, una librería anterior que introdujo una aproximación matemática innovadora en el estado del arte, pero que también presentaba una serie de carencias que fueron subsanadas, alcanzado un software que mejor en materia de alcance, precisión, tiempo de ejecución y usabilidad.
PyToxo se presenta a la comunidad científica como una utilidad libre e interesante para el ámbito de investigación de los estudios de asociación del genoma completo, disponible bajo los términos de la licencia GNU General Public License v3.0.
Repositorio del proyecto: <https://github.com/bglezseoane/pytoxo>.
Licencia del proyecto: <https://github.com/bglezseoane/pytoxo/blob/master/LICENSE>. | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2021-10-07 08:19 |
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MPI3SNP
- MPI3SNP é unha ferramenta software paralela para a detección de interacción xenética en Estudos de Asociación do Xenoma. Fai unha búsqueda entre todas as combinacións de ata tres loci atopando aquelas involucradas na expresión dun fenotipo. | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2018-09-03 07:09 |
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Conshuga
- Conshuga é un conxugador automático de verbos galegos (ILG/RAG). | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2009-06-10 15:36 |
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FORMIGA
- FORMIGA é un software que permite o re-aproveitamento dos recursos das aulas de informática para a realización de cálculos científicos. O software desenvolvido baséase en tecnoloxía grid, virtualización e redes privadas virtuais. | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2009-06-17 08:58 |
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DepPattern
- DepPattern é un conxunto de ferramentas de análise sintática multilingüe: contén un compilador de gramáticas, POS-taggers e parsers baseados na gramática de dependencias. | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2009-06-17 09:37 |
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ProtTest-HPC: Protein model selection
- ProtTest-HPC é unha ferramenta bioinformática para a selección de modelos de evolución proteínas que permite un mellor aproveitamento dos recursos computacionáis tanto en memoria compartida como distribuida. http://darwin.uvigo.es/prottesthpc | |
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Activity Percentile: 0.00 Registered: 2010-10-05 09:28 |
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FreeLing POS-tagger Galego e Portugués
- Este proxecto contén os ficheiros de treino, dicionarios e regras de lematización verbal e nominal do módulo de anotación morfosintática do FreeLing para Galego e Portugués. | |
| Activity Percentile: 0.00 Registered: 2009-06-10 16:02 | |
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